SARS-CoV-2
| Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 | |
|---|---|
 Gambaran mikroskop transmisi elektron yang menunjukkan virion SARS-CoV-2 | |
.png) Ilustrasi koronavirus nang diulah ulih Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit (CDC). | |
Rekaman (id)  | |
|
| |
| Data (id) | |
| Inang (id) |
Homo sapiens (id) , Felis catus (id) , Canis familiaris (en) , VeroE6/TMPRSS2 (en) , Vero C1008 (en) , Caco-2 (en) , Calu-3 (en) , HEK293T (en) wan Huh-7 (en) |
| Komposisi genom virus ICTV (id) |
positive-sense single-stranded RNA virus (en) |
| Garing | Pandemi COVID-19 wan Panyakit koronavirus 2019 |
| Jumlah genom (id) | 29.903 |
|
| |
| Taksonomi (id) | |
| superdomain | Biota |
| domain | Virus |
| Dunia (virologi) | Riboviria |
| kerajaan | Orthornavirae |
| filum | Pisuviricota |
| kelas | Pisoniviricetes |
| ordo | Nidovirales |
| famili | Coronaviridae |
| upafamili | Orthocoronavirinae |
| genus | Betacoronavirus |
| upagenus | Sarbecovirus |
| spesies | Severe acute respiratory syndromeKladrelated coronavirus |
| Tanpa nilai | Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 |
| Tata nama (id) | |
| Dinamakan berdasarkan (id) |
SARS-CoV (id) |
| Sinonim takson (id) |
|
 | |
Koronavirus sindrom pahinakan akut barat 2 atawa SARS-CoV-2[1][2] (basa Inggris: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) adalah sabuting angguta koronavirus nang maulah jangkitan pahinakan COVID-19. Virus ngini panambaian diidintipikasi di Kuta Wuhan, Tiongkok wan maulah pandemi COVID-19. Virus naya jua dipinandui sebagai koronavirus Wuhan dan virus pneumonia pasar makanan laut Wuhan (Wuhan seafood market pneumonia virus).[3]
Genom virus naya sudah diurutkan.[4][5][6] Pabandingan urutan genetik antara virus naya wan sampel virus lain manunjukkan tingkat kasamaan lawan SARS-CoV saganal 79,5% wan lawan koronavirus kalalawar saganal 96%.[7] Beberapa teori menyimpulkan bahwa virus naya berasal dari kalalawar.[8][9][10]
Pangaranan[babak | babak asal mulanya]
Salawas wabah nang haratan balangsung, virus ngni rancak disambat sacara umum sabagai "koronavirus", "koronavirus hanyar" wan "koronavirus Wuhan",[11][12] amum WHO manyaranakan ngaran pahadangannya "2019-nCoV" di tangah katakutanan bahwa kadada ngaran rasmi nang kawa maulah pamakaian ngaran-ngaran infurmal nang marugiakan, per padjman WHO tahun 2015,[12][13]
Kalumpok Studi Koronavirus matan Komite Internasional Taksonomi Virus (ICTV) mambari'i virus naya ngaran koronavirus sindrom pahinakan akut barat 2 (SARS-CoV-2) nang marupakan galur dalam spesies SARS-CoV.[2] Panyakit nang disababakan ulih virus ngini dibari ngaran "penyakit koronavirus 2019" (COVID-19) ulih WHO.[14]
Struktur biologi[babak | babak asal mulanya]
Publikasi genom mambari jalan gasan sapalihan pemodelan protein gasan protein pangikat reseptor (RBD), yaitu protein spike (S). Protein S dipinandui mampartahanakan afinitas nang cukup tahadap reseptor enzim pengubah angiotensin 2 (ACE2) wan mamakainya gasan masuk ka dalam sel.[16] Pas 22 Januari, dua kalumpuk nang balaim (sabuting di Tiongkok nang bagawi lawan virus langkap wan sabuting di AS nang bagawi lawan genetik balik) sacara independen manampaiakan paranan ACE2 gasan reseptor di SARS-CoV-2.[17][18][19]
Gasan mencari protease inhibitor nang potensial, enzim endopeptidase C30 mata poliprotein rangka baca terbuka 1a (Orf1a) dimodelkan jua gasan parcobaan docking obat. Innophore sudaj mahasilkan dua model komputasi badasarkan protease SARS,[15] wan Akademi Ilmu Pengetahuan Tiongkok sudah mahasilakan struktur eksperimental rekombinan protease SARS-CoV-2 nang balum dipublikasiakan [20]
Catatan Batis[babak | babak asal mulanya]
- ^ Gorbalenya, Alexander E. (11 Februari 2020). "Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus – The species and its viruses, a statement of the Coronavirus Study Group". bioRxiv (dalam bahasa Inggris): 2020.02.07.937862.
- ^ a b "ICTV". Diakses tanggal 12 Februari 2020.
- ^ Zhang, Y.-Z.; et al. (12 Januari 2020). "Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome". GenBank. Bethesda MD. Diakses tanggal 13 Januari 2020.
- ^ "中国疾病预防控制中心". chinacdc.cn. Diakses tanggal 9 Januari 2020.
- ^ "New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert". Xinhua. Diakses tanggal 9 Januari 2020.
- ^ "CoV2020". platform.gisaid.org. Diakses tanggal 12 Januari 2020.
- ^ http://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.914952v1.full.pdf
- ^ Sampel CoVZC45 and CoVZXC21, lihat visualisasi interaktif
- ^ "The 2019 new Coronavirus epidemic: evidence for virus evolution".
- ^ Callaway, Ewen; Cyranoski, David (2020-01-23). "Why snakes probably aren't spreading the new China virus". Nature (dalam bahasa Inggris).
- ^ Taylor-Coleman, Jasmine (5 Februari 2020). "How the new coronavirus will finally get a proper name" (dalam bahasa Inggris). BBC. Diarsipkan dari versi asli tanggal 5 Februari 2020. Diakses tanggal 12 Februari 2020.
- ^ a b Stobbe, Mike (8 Februari 2020). "Wuhan coronavirus? 2019 nCoV? Naming a new disease". Fortune (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 12 Februari 2020.
- ^ World Health Organization Best Practices for the Naming of New Human Infectious Diseases. Organisasi Kesehatan Dunia. Mei 2015.
- ^ "WHO Director-General's remarks at the media briefing on 2019-nCoV on 11 February 2020". www.who.int (dalam bahasa Inggris). Organisasi Kesehatan Dunia. Diakses tanggal 11 Februari 2020.
- ^ a b Gruber, Christian; Steinkellner, Georg (23 Januari 2020). "Wuhan coronavirus 2019-nCoV - what we can find out on a structural bioinformatics level". Innophore Enzyme Discovery. Innophore GmbH.
- ^ "Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission". SCIENCE CHINA Life Sciences. Diakses tanggal 23 Januari 2020.
- ^ Letko, Michael; Munster, Vincent (22 Januari 2020). "Functional assessment of cell entry and receptor usage for lineage B β-coronaviruses, including 2019-nCoV". BiorXiv. Diakses tanggal 28 Januari 2020.
- ^ Zhou, Peng; Shi, Zheng-Li (2020). "Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin". BiorXiv. doi:10.1101/2020.01.22.914952. Diakses tanggal 24 Januari 2020.
- ^ Gralinski, Lisa E.; Menachery, Vineet D. (2020). "Return of the Coronavirus: 2019-nCoV". Viruses. 12 (2): 135.
- ^ "上海药物所和上海科技大学联合发现一批可能对新型肺炎有治疗作用的老药和中药". Akademi Ilmu Pengetahuan Tiongkok. 25 Januari 2020.